Spróbuj mojej metody. Nie musisz robić RAW+JPG żeby szybciej przeglądać zdjęcia. Jeżeli tylko dlatego robisz RAW+JPG aby szybciej przeglądać foty, to trochę zły pomysł. Ja w coś takiego nie wchodzę, bo potrzebuję czasami szybkiego zapisu w serii.
Ściągnij sobie XnView i rób tylko w RAW. Zrzucasz RAWy do jednego katalogu i odpalasz XnView. Przeglądasz zdjęcia w RAW tak samo szybko jak JPG. Wszystko oczywiście w dużym formacie, nie jakieś tam miniaturki.
Jak Ci się zdjęcie podoba to je zostawiasz i przechodzisz "Spacją" do kolejnego. A jak nie to je usuwasz "Delete". Oczywiście po zaakceptowaniu poprzez "Tak" lub "Nie".
Jak masz ochotę zrobić sobie na szybko obróbkę danego RAWu, to "lewy Alt+1" otwiera Ci go w (Camera Raw) PS. A "F4" w skojarzonym edytorze (np LR).
Czasami z meczu mam 350 zdjęć i potrzebuję przeprowadzić selekcję zdjęć np 2, albo 3 razy, żeby zostawić tylko dobre foty. Dla mnie XnView działa wygodniej pod tym względem niż np Adobe Bridge.
Wracając do Twojego pytania, to z tego co (prawie) zrozumiałem, chodzi Ci o usuwanie par RAW+JPG (złych zdjęć) i pozostawienie tylko (dobrych) RAW.
Z pomocą może przyjść np PHP. Ale wtedy trzeba sobie postawić na kompie np serwer Apache i trochę się pobawić. Operacje na plikach i katalogach. Musisz wtedy wrzucić (skopiować) w odpowiednie miejsce twój katalog i odpalić skrypt.
Który wczyta zawartość katalogu z plikami np z rozszerzeniem .CR2 i gdy znajdzie odpowiednik .JPG, to taką parę usunie. Wtedy zostaną tylko dobre RAW. Dla początkującego amatora w PHP to prosta sprawa.