Nie wydaje mi się że pierwsza karta zapełniła się przy 9999 tylko zapisywało się na niej dalej od nowa czyli od 0001. A wygląda że na drugiej karcie zapis ruszył od 0385.
Poszukaj na pierwszej karcie zdjęć 0001-0384.
A karty czytasz czytnikiem czy przez USB ? I sprawdź ręcznie co jest na pierwszej karcie. Może są 2 katalogi zdjęć. A program importujący automatycznie uznał że masz już zdjęcia 0001-0384 na kompie i nie kopiował ich.