To co mi przychodzi do głowy to, że może czujniki AF-u się zabrudziły???
No spróbuj najpierw przedmuchać gruszką czujniki AF (są pod lustrem). Też mi się kiedyś paproch przyczepił i AF wariował. Nie wiem jak dokładnie wygląda kalibracja body, ale jeśli jest to wykonywane mechanicznie to może międzyczasie poluzowała Ci się jakaś śrubka?