Niestety, nie znam sposobu żeby przefiltrować foldery źródłowe "po rozszerzeniu". Ponieważ jednak i tak wszystkie pliki znajdą się w nowej strukturze katalogowej, a dwa rawy czy jpegi raczej rzadko nazywają się tak samo, możesz zrobić tak: za pomocą "Wyszukaj" w eksplorerze Windows znaleźć wszystkie interesujące Cię pliki wg zadanego rozszerzenia i przenieść je do jednego katalogu, który potem zaimportować Lightroomem przez "Move". Trochę toporne, wiem, ale działa.
Co do swoich presetów wstępnych:
1. w widoku "Develop" wybierasz dowolne zdjęcie, najlepiej jakiegoś śmiecia i naciskasz na nim PPM oraz Setting/Reset - zdjęcie wraca do stanu surowego.
2. wrzucasz na nim takie zmiany, jakie chcesz mieć w presecie - ja np. polecam WB na "Auto" nie na "As shot" (czyli to LR automagicznie będzie określał temperaturę i odcień, a nie aparat - uważam że LR robi to lepiej niż Canon, z Nikonem mam bardziej ambiwalentne odczucia - wiem, to może być kontrowersyjne), zaznaczam "Enable Profile Correction" i jego setup na "Auto", no i (Nikon only) w Camera Calibration odpowiedni profil barwny (D2X mode 2 dla Nikona chyba najbardziej przypomina Canon Standard)
3. Z lewej strony, w bloku Presets naciskasz "+", nazywasz jakoś ten preset, wybierasz dla niego kategorię (zwykle "User Presets") i zaznaczasz co ten preset ma aplikować - ja wybieram wg punktu 2: Auto Tone (co wyklucza ustawienia z Basic Tone, bo dobiera je automatycznie), White Balance, Lens Correction, Process Version i Calibration.
4. Preset łatwo się modyfikuje - możesz wyresetować zmiany w zdjęciu, przyłożyć swój preset, poprawić i prawym przyciskiem na nazwie presetu w boksie Presets wybrać "Update with Current Settings".
5. Definiując preset importowy, ustawiasz ten preset w "Apply During Import/Develop Settings".