A propos SyncToya 2.1 sprawdź czy rzeczywiście system nie wykrywa zmiany litery dysku zgodnie z opisem na stronie MS
"Dynamic Drive Letter Assignment: Drive letter reassignment will now be detected and updated in the folder pair definition."
Z tego co pamiętam w czasie kiedy go używałem ta funkcja działała.

Rzuć okiem na LiveSync, używam go w czasie wyjazdów - o ile mam dostęp do neta.

Pozdrawiam