Mało który soft do backupu potrafi śledzić zmiany. Zależy to od wersji systemu operacyjnego i systemu plików, który backupujemy. Komercyjny Tivoli Storage Manager potrafi to zrobić, ale tylko na NTFS.
Spróbuj pokombinować z wywoływaniem go bezpośrednio z tego dysku, który backupujesz.
W domku Syncbackup, w pracy ten pierwszy wspomniany przeze mnie.