Cokolwiek do usuwania zduplikowanych plików powinno się nadać. tu:
http://www.snapfiles.com/freeware/ masz tony freeware'u
A do usuwania zduplikowanych obrazków to np. picasa się nadaje o ile pamiętam.
Jest bardzo fajne narzędzie, dupdetector się nazywa, ale niestety działa tylko do jpegów.