W Photomatix możesz bezpośrednio otworzyć plik raw, program odpowiednio wywoła raw i utworzy tzw pseudo-hdr efekt będzie prawie identyczny jak w przypadku forsowania ekspozycji do trzech plików. Poza tym jeżeli decydujesz się na forsowanie ekspozycji to najlepiej te pliki zapisać jako TIFF ponieważ skompresowane jpg'i przemielone przez maszynkę do hdr dadzą marny efekt końcowy. Jeżeli chodzi o Twoje pytanie to wydaje mi się że większość programów do HDR powinno posiadać korektę ekspozycji dla plików ale jeżeli konieczna jest zmiana tego parametru w EXIF'ie to po wywołaniu potraktuj tego jpg'a jakimś programem do zmiany parametrów w EXIF'ie, zapewne pełno tego w sieci, może ktoś podpowie ja się w to nie bawiłem bo nie widzę potrzeby.
Pozdrawiam