Udało mi się przypadkowo znaleźć rozwiązanie problemu zatem zamieszczam je dla wszystkich, którzy mają podobny problem.

Wyłączyłem (przełącznikiem na obudowie) Wifi i BT i dopiero po tym podłączyłem aparat do USB. O dziwo EOS Utility uruchomił się ze wszystkimi funkcjami aktywnymi. Nie wiem czy to wina komórki, która również widzi się jako urządzenie WIA, myszki BT czy Wifi ale choć kulawe - jest to rozwiązanie problemu.

Na stronach Canona znalazłem informację, że przygotowywana jest poprawka.