Mając kilka kont ftp możesz dać komuś dostęp do części konta, np. webmasterowi, który tworzy tobie jakiś serwis, nie widzi co masz jeszcze na serwerze. Mając kilka kont ftp dajesz kilka haseł i dostępów, czyli kilka osób robi coś jednocześnie na serwerze nie przeszkadając sobie i nie grzebiąc po całym serwerze.
Jak masz tylko jedno konto to otwierasz dostęp do całej zawartości konta = duże ryzyko, gość grzebie sobie po twoim całym serwerze!