Na moim 350 też tak miałem.
Sprawę rozwiązałem ręcznym uruchamianiem EOS Utility.
Dodałem sobie skrót do paska zadań:
"C:\Program Files\Canon\EOS Utility\EOS Utility.exe"

Co ciekawsze z 40D ten sam soft działa bez problemów.
Z canon-europe mam pozakładane najnowsze wersje programów.
http://software.canon-europe.com/