Na szybko, z głowy i praktyki, a nie tabelek i zestawień:
1000d:
+ nowy
+ LV
+ lepszy akumulator
+ ISO w wizjerze
400d:
+ lepszy AF
+ pilot na podczerwień
Jest pewnie jeszcze kilka innych, drobnych różnic.
Podsumowując: kto stawia na AF, powinien wziąść 400d, kto ma czas na zabawy z LV, to 1000d.
P.S. Jak chcesz wybierać pomiędzy Nikonem, a Canonem to zacznij od obiektywów a nie korpusów.