Można. Wspomnianym wcześniej programem exiv2... Komendą "exiv2.exe ex" można wyciągnąć całego exifa z oryginalnego pliku jpg lub cr2 do pliku exv. Później, po obróbce np. photoshopem można wrzucić z powrotem te dane do pliku jpg (komendą "exiv2.exe in").
Można to wykonać dla wszystkich plików w katalogu (np. "exiv2.exe ex c:\*.cr2")